Для расчета автоселективов используются данные по кампаниям пользователя или по всей системе?

CR средний по сайту (по всей системе) не влияет.

Занижение/завышение сайта происходит, исходя из фактических данных по этому сайту для конкретной кампании.

Подробнее с тем, как работают автоселективы, можно ознакомиться по ссылке.