Si te hacen una entrega a cuenta, cuando has hecho por ejemplo, un presupuesto, puedes añadir ese pago a cuenta, desde dentro del mismo presupuesto, en el apartado 'Pagos a cuenta':
Luego, cuando conviertas ese presupuesto en factura, ese pago a cuenta se convertirá en un vencimiento pagado dentro de la factura.
Ten en cuenta que los pagos a cuenta, no salen en los documentos. Están añadidos al programa para tu información, pero no te saldrán hasta que hagas la factura, que sí que verás en el PDF el vencimiento cobrado.
Si quieres, puedes imprimir el pago a cuenta, eso sí, desde el icono de una impresora que te saldrá en la misma línea del pago a cuenta
Si tienes dudas, avísame.