Manageboardに反映可能な補助科目の上限数1,000件を超えているためエラーが発生している可能性があります。
エラーを解決するためには、下記の2パターンがあります。
１）不要な補助科目を削除する
２）補助科目の実績データを取りこまない設定にする

１）不要な補助科目を削除する
①管理＞タグ＞タグカテゴリ「補助科目」＞不要な補助科目を削除

※一度削除した補助科目は復元することは出来ません。

２）補助科目の実績データを取りこまない設定にする
下記手順で特定の補助科目の実績データを取り込まないように設定。
①実績＞データ取込＞「詳細データを取り込む場合はこちら」をクリック
②マスタの割当＞「設定する」をクリック

③補助科目タブを選択＞取り込む列にて取り込みたくない補助科目のチェックを外す＞画面右下「現在のページを保存」＞画面左上「データ取込」

④実績の反映「反映する」をクリック

※２）の方法だとManageboard上から補助科目のデータは削除されないため、適宜取り込む／取り込まない設定を行えます。