Sim, o troco é calculado automaticamente. O MeuPet mostra o valor de troco que deve ser retornado ao cliente, caso ele opte por um método de pagamento que permita troco.
Por padrão a forma de pagamento Dinheiro já está configurada para permitir troco.
Para configurar o troco para outras formas de pagamento é só acessar o menu lateral à esquerdo Financeiro > Métodos de pagamento e escolher qual a método de pagamento deseja ativar a possibilidade de troco.
Algumas observações importantes:
Não é possível gerar troco com valor superior ao digitado no método de pagamento.