機能ごとに順位取得の仕様が違うためです。目視と一番近い順位は、リアルタイムで取得している競合分析の順位です。

・ランキング：毎日0時から朝方にかけて一度、検索順位を取得しています。

・競合分析：リアルタイムに検索順位を取得しています。

・記事作成：

　>GSC連携あり：Googleサーチコンソールの順位データ

　>GSC連携なし：データ取得日に基づく順位が表示されます。(約1ヶ月ごとに更新)

・流入分析：

　 >トラフィック：データ取得日に基づく順位が表示されます。(約1ヶ月ごとに更新)

　>GSC連携あり：Googleサーチコンソールの順位データ

ご自身で管理しているサイトで、Googleサーチコンソールを設定している場合は、キーワード順位が無制限に取得できる「GSC連携あり」で分析することをお勧めします。

なお、GSC連携時の順位は、自然検索(オーガニック)結果の順位だけではなく、画像検索などの要素も順位に反映されます。

詳しくは、こちらにて解説しています。