右のプロパティパネルを使ってレイヤを動かそうと思ったら、

プロパティパネルから位置指定のためのツールが消えてしまい、焦ってしまう。

これ、「dpdp あるある」 です。

原因は、なにかの操作のはずみでレイヤがステージの外に出ちゃったからなんです。

そういう時は、大抵、下の図のように右のプロパティパネルからレイヤの位置を

調整するツールが無効になっていたり、調整ツールそのものが空白になっていたりします。

そんな時は、慌てず騒がず、まず左のレイヤツリーを見てみましょう。

大抵の場合、図のようにレイヤがステージと並列（ステージ外に出ている）状態になっていると思いますので、そのレイヤを、レイヤツリーでステージの中にドラッグしてください。

きっと、それで解決します。