Para añadir un campo personalizado a tus documentos, deberías ir primero a 'Configuración' -> 'Campos personalizados' y luego seleccionas para qué documento quieres ese campo:
Y añades el campo que necesitas y guardas.
Una vez creado, ese campo puede ser solo para que lo veas tu en la página de edición del documento, pero que no salga en el PDF ( con lo que no tendrías que hacer nada más) o bien, puedes configurar la plantilla para que ese campo se muestre en el PDF del documento.
Para que salga en el PDF del documento, deberías ir a 'Configuración' -> 'Personalización de documentos' y 'Plantillas de factura':
En la siguiente página con el cursor encima de la plantilla le das a 'Modificar' y en la pestaña 'Etiquetas' en la zona de 'Cabecera extra' abres el desplegable de 'Cabecera extra 1' y seleccionas el campos personalizado que has creado:
No olvides 'Guardar' los cambios.
Ahora ya podrás emitir facturas con el campo personalizado visible en el PDF del documento.
Gracias,