勤怠でマイナス計上する方法を教えてください。

過不足金での対応が可能です。
基本的に過不足金は、イレギュラーな追加金額を登録する目的で使用します。ただ、応用として登録する固定金額にマイナスをつけることで
給与からのみマイナス計上という操作も行えます。

過不足金登録の詳細操作は下記をご覧くださいませ。