O protocolo de agravo de instrumento deve ser feito como o de qualquer petição inicial: clique no botão "Inicial" que fica ao lado esquerdo da barra de pesquisa (em qualquer inbox) e preencha o formulário.
A única peculiaridade é que o campo "Classe" desse formulário deverá ser preenchido com a opção "Agravo de Instrumento".
Um dos campos seguintes irá pedir o número do processo de referência, que deverá ser o do processo de origem.