Para registrar e informar el Cambio de Contrato de un Trabajador se debe editar en la ficha del trabajador y en los movimientos mensuales.

Ficha de Trabajador.

Nomina> Empleados> Trabajador> Editar. 

En la pestaña Personal hacemos el cambio en tipo de contrato. 

Movimientos Mensuales. Luego de esto debes ir a: Nómina> Nómina> Movimientos Mensuales> Movimientos por Empleado> Seleccionamos trabajador y periodo> Codigo mov personal> Cambio Contrato> Fecha> Grabar.