Debes ingresar en la ficha del empleado para actualizar la información para ello ingresas al módulo Nomina> Empleados> filtrar el mes que desea hacer el cambio y luego selecciona al empleado> click editar. 

Al ingresar a la ficha del trabajador vamos a la pestaña "FICHA" y procedemos a seleccionar la ISAPRE correspondiente.

Luego nos dirigimos a la pestaña "PERSONAL" y ubicamos los parámetros de ISAPRE, Seleccionas el nuevo tipo de plan de salud, si es proporcional o no y el valor del plan según el tipo. La siguiente imagen puede servirte como ejemplo.